Фамилия Деффо — одна из тех, что почти наверняка пришла в русский язык извне, и её происхождение лежит не в славянской ономастике, а в западноевропейской. В русском контексте она встречается крайне редко, и её носители, скорее всего, имеют иностранные корни или являются потомками обрусевших семей.

Наиболее очевидная и правдоподобная версия связывает фамилию с французским или английским написанием. Сравните с известной фамилией писателя Даниэля Дефо (Daniel Defoe). В оригинале она пишется Defoe, но в русской транскрипции XIX — начала XX века часто встречался вариант «Деффо» с удвоенной «ф», что отражало произношение или особенности передачи звука. Основа фамилии восходит к французскому «De Foe» — частица «де» указывает на дворянское происхождение или место, а «Foe» могло быть топонимом или прозвищем. Таким образом, фамилия Деффо могла означать «из Фо» или «принадлежащий Фо».

Менее вероятно, но возможно, что фамилия имеет искусственное или литературное происхождение. В среде русских интеллигентов или актеров в XIX веке было модно брать псевдонимы, созвучные европейским. Кто-то мог взять фамилию знаменитого писателя, слегка изменив написание, чтобы подчеркнуть свою образованность или связь с культурой.

Морфологически фамилия не склоняется по русским правилам (как и многие заимствованные на -о, -е, -и), что также выдает её нерусское происхождение. Суффиксальная модель отсутствует — это корень, застывший в форме. Если искать аналогии в русских фамилиях, то ближе всего стоят редкие варианты вроде «Фофо» или «Фофанов», но они имеют совершенно другую этимологию (от канонического имени Фотий).

В России носители фамилии Деффо — это, скорее всего, потомки обрусевших французов, англичан или людей, получивших фамилию при крещении от иностранного духовенства. Географически такие фамилии чаще встречались в Санкт-Петербурге и крупных портовых городах, где была сильна европейская диаспора. Дворянского статуса у неё, скорее всего, не было — это фамилия городской интеллигенции или купечества, имевшего дело с Западом.