Фамилия Дрохнерис — редкая и необычная для русского ономастикона. Её происхождение, скорее всего, не связано с традиционными восточнославянскими моделями образования (суффиксы -ов, -ин, -ский). Словообразовательный анализ подсказывает, что перед нами фамилия-композит или искусственное образование, причём её звучание отсылает к южноевропейским или вымышленным языковым традициям.

Наиболее правдоподобная гипотеза — связь с греческим корнем «дрохн-» (δρόχνος — «петля», «силок», «сеть», либо с искажением от «дрохос» — «бег», «путь»). В греческой ономастике встречаются фамилии, оканчивающиеся на -ерис (например, Патерис, Катерис), что характерно для островной или малоазийской греческой традиции. Таким образом, Дрохнерис могла возникнуть как прозвище человека, занимавшегося ловлей сетями (рыбака, птицелова) или, в переносном смысле, хитрого, изворотливого человека. Вторая часть — «-ерис» — указывает на принадлежность (буквально «сын Дрохна» или «из рода Дрохна»).

Вторую версию подсказывает современная культура: фамилия практически идентична имени Дейенерис из цикла «Песнь Льда и Пламени» Джорджа Мартина. Нельзя исключать, что носители фамилии — это люди, сознательно взявшие псевдоним или изменившие фамилию под влиянием эпопеи, либо же это редкий случай, когда литературное имя прижилось в реальном быту. Однако для исконной, исторической фамилии такая версия маловероятна — она не фиксируется в дореволюционных метриках и переписях.

Если фамилия реально бытовала в Российской империи, её могли принести греческие переселенцы (например, из Крыма или Приазовья) или выходцы с Балкан. В таком случае она могла подвергнуться русификации: окончание -ис заменялось на -ов/-ев, и фамилия могла выглядеть как Дрохнерисов. Но в исходной форме Дрохнерис — это яркий пример фамилии, которая либо является очень поздним заимствованием, либо искусственным конструктом, и её носителю стоит проверить семейные архивы на предмет греческих или недавно изменённых корней.