Фамилия Дшхунян — редкий случай, когда основа не поддаётся однозначной славянской или тюркской этимологии. Скорее всего, перед нами армянская фамилия, образованная по классической модели с суффиксом -ян (вариант -янц), который в русской передаче часто теряет конечный -ц. Суффикс -ян в армянском языке означает принадлежность к роду или происхождение от предка: буквально «из рода такого-то».

Корень «Дшхун» (или «Дшхунц») не имеет прямого аналога в общеупотребительной армянской лексике, но может восходить к диалектному прозвищу или топониму. В армянских говорах встречаются основы со значением «быстрый», «резкий» или «горячий», но точное значение здесь требует проверки по местным говорам. Возможна и более прозаичная версия: фамилия могла возникнуть от названия небольшого села или хутора, где жил основатель рода, — такие случаи в армянской ономастике нередки.

Написание «Дшхунян» с начальным «Дш» — явный признак того, что фамилия прошла через русскую транскрипцию. В оригинальном армянском написании (на грабаре или ашхарабаре) сочетание звуков могло передаваться иначе, а при записи в российских документах XIX века произошло упрощение или замена букв. Это типичная ситуация для фамилий из Закавказья, которые фиксировали чиновники, не знакомые с местной фонетикой.

Сословно носители фамилии Дшхунян, скорее всего, относились к крестьянам или ремесленникам — армянские фамилии на -ян в массе своей недворянские. Однако без конкретных генеалогических данных утверждать что-либо сложно: в армянской среде были и княжеские роды с таким суффиксом, но они обычно имели узнаваемые основы (Меликян, Арцрунян). Дшхунян — фамилия, которая скорее говорит о конкретном роде из определённой местности, чем о широком распространении. Встречается она крайне редко, что делает её ценной для семейной истории: каждый носитель может быть потомком небольшой родовой группы, сохранившей уникальное имя.