Фамилия Дундученко — характерный пример украинской фамилии, образованной по модели, распространённой на Левобережной Украине. Её основа — прозвище Дундук, которое легло в основу фамилии через патронимический суффикс -енко, буквально означающий «маленький» или «сын». Таким образом, Дундученко — это «сын Дундука» или потомок человека с таким прозвищем.

Ключ к пониманию фамилии — в слове «дундук». В украинских и южнорусских говорах у этого слова несколько значений, и все они нелестные. Чаще всего дундуком называли упрямого, туповатого или нерасторопного человека, тугодума. В некоторых диалектах так могли назвать и заносчивого, надутого человека. Интересно, что в украинском языке встречается и слово «дунда» с похожей семантикой — «гордец» или «неповоротливый». Прозвище, скорее всего, давали за особенности характера или поведения, которые бросались в глаза окружающим.

Словообразовательная модель на -енко доминировала в Поднепровье (современные Черкасская, Полтавская, Кировоградская области) и была типична для казацкой среды. В XVII–XVIII веках такие фамилии фиксировались в реестрах Войска Запорожского и среди крестьян Гетманщины. Дундученко — фамилия, которая почти наверняка имеет украинские корни, а её география бытования сегодня охватывает преимущественно центральные и восточные области Украины, а также юг России, куда переселялись украинцы в XIX веке.

В отличие от фамилий с суффиксами -ов/-ев, которые указывали на принадлежность отцу (Иванов — сын Ивана), фамилии на -енко подчёркивали именно родственную связь по мужской линии, часто в уменьшительной форме. Поэтому Дундученко — это не просто «относящийся к Дундуку», а именно его прямой потомок или младший член семьи. С течением времени прозвищная основа утратила свою негативную окраску, и фамилия стала просто родовым именем, которое не связано с характером её современных носителей.