Фамилия Дусеков — редкий случай, когда основа, скорее всего, тюркская, а суффикс — русский, крестьянский. Модель образования проста: к личному имени или прозвищу Дусёк (Дусек) добавили патронимический суффикс -ов, получив «сын Дусека». Вопрос в том, что значило это «Дусёк».

Самая вероятная версия отсылает к татарскому или башкирскому слову «дус» — друг, товарищ. Уменьшительно-ласкательная форма Дусёк (дружок, приятель) могла стать мирским именем, которое давали ребёнку в знак пожелания дружелюбного характера, либо прозвищем общительного человека. В русских говорах Поволжья и Приуралья, где тюркское влияние было сильным, такие заимствования нередки, и фамилия Дусеков встречается именно в этих регионах — в Оренбургской, Челябинской областях, Башкортостане.

Версия о происхождении от русского слова «дусёк» (ласкательное от «душа» или «дух») менее убедительна: в диалектах такое слово не зафиксировано как распространённое, а в качестве прозвища оно бы дублировало более частые Душин, Духов. Зато тюркский «дус» даёт чёткую смысловую параллель с фамилиями Дусов, Дусев, которые встречаются у татар и башкир.

Суффикс -ов указывает, что фамилия оформилась уже в русской среде, скорее всего, среди крестьян или казаков, которые общались с тюркским населением. Носители фамилии Дусеков — потомки человека, которого в деревне звали не по имени, а по прозвищу Дусёк, и это прозвище говорило о нём как о верном товарище, «своём» человеке.