Фамилия Двенарин — один из тех редких случаев, когда в основе лежит не имя, не прозвище и не ремесло, а числительное. Она образована от слова «двенадцать» (в старой форме «двенадесять» или «двенадцать») с помощью патронимического суффикса -ин, который в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — Двенарин, то есть сын или потомок Двенара.

Само прозвище Двенар (или Двенара) могло возникнуть в среде, где счёт имел бытовое или социальное значение. В русских говорах слово «двенадцать» иногда использовалось для обозначения дюжины — меры счёта для мелких товаров (яйца, холсты, лён). Человека, который торговал дюжинами, принимал товар по дюжинам или имел какое-то отношение к числу двенадцать (например, двенадцатый ребёнок в семье), могли прозвать Двенаром. В этом смысле фамилия встаёт в один ряд с такими редкими числовыми фамилиями, как Сорокин, Шестаков, Девятин, но Двенарин стоит особняком — «двенадцать» в прозвищах встречается намного реже, чем круглые или малые числа.

Другая, менее вероятная версия связывает фамилию с диалектным словом «двенара» — так в некоторых областях называли двуручную пилу или особый вид плуга. Тогда прозвище Двенара мог получить плотник или пахарь, работавший таким инструментом. Однако эта гипотеза слабее: слово «двенара» в значении орудия почти не зафиксировано в словарях, а числовая версия опирается на понятную и распространённую модель образования прозвищ.

С географической точки зрения фамилия Двенарин не привязана к какому-то одному региону — она единична и встречается точечно. В дореволюционных переписях и метрических книгах носители этой фамилии не образовывали больших гнёзд. В советское время фамилия не исчезла, но осталась на уровне редких. По сути, Двенарин — это «фамилия-загадка»: её обладатели, скорее всего, ведут род от одного человека, получившего прозвище по счёту или по торговле дюжинами, и с тех пор фамилия не размножилась широко.