Фамилия Двоенкова — женская форма фамилии Двоенков, которая в свою очередь происходит от прозвища или мирского имени Двоенок. В основе лежит корень «дво-», связанный с числительным «два» или понятием «двойной». Чаще всего так называли второго ребёнка в семье, близнеца («двойняшка») или человека, родившегося в какой-то парной ситуации. Реже прозвище Двоенок могли дать за двойственность характера или за то, что человек делал всё дважды.

Суффикс -енк- в основе характерен для восточнославянских, особенно украинских и южнорусских говоров. В украинском языке суффикс -енко образует фамилии со значением «маленький» или «сын такого-то» (например, Двоенко — сын Двоя). В русской традиции этот суффикс мог быть уменьшительным или указывать на происхождение из определённой местности. Фамилия Двоенков (а следовательно, и Двоенкова) — типично русская по форме, с патронимическим суффиксом -ов, который означает «принадлежащий Двоенку» или «из рода Двоенка».

Интересная особенность: фамилия Двоенков и её женский вариант Двоенкова — редкие. Они встречаются в основном в центральных и южных областях России, а также в Беларуси. Это не дворянская фамилия — скорее всего, предки носителей были крестьянами или мещанами. В документах XVII–XVIII веков можно найти упоминания крестьян с похожими прозвищами, например, Двойников или Двояк, но Двоенков — более локальная форма.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, Двоенкова стоит в ряду с Двояковым, Двоиным, Двойниковым. Но суффикс -енк- выделяет её: он говорит о том, что прозвище Двоенок было не просто описательным, а, возможно, ласкательным или ироничным. В быту так могли называть не только двойняшку, но и человека, который постоянно путал вещи или делал всё парами — например, носил две шапки или ходил с двумя палками.