Фамилия Дюдюрка — случай, когда внешний облик слова обманчив. На первый взгляд она кажется иноязычной, напоминающей французские или румынские фамилии на -ю, но на деле её корни чисто русские, южнорусские или украинские. Основа фамилии — глагол «дюдюрить» или существительное «дюдюрка», которые в говорах означают «дудка», «свирель», а также «дудочник» или «тот, кто играет на дудке». Человек, получивший такое прозвище, скорее всего, был музыкантом-пастухом, игравшим на простом народном инструменте, или же сам мастером, делавшим дудки.

Суффикс -к(а) в фамилиях восточных славян — явление редкое. Обычно он встречается в прозвищах, которые затем закреплялись как фамилии без дополнительного суффикса принадлежности (-ов, -ин). Фамилия Дюдюрка — это застывшая форма прозвища. В отличие от, скажем, фамилии Дудкин, где есть суффикс -ин, указывающий на сына Дудки, Дюдюрка — это прямое прозвище, которое могли дать самому музыканту. В украинской ономастике такие «голые» прозвища в роли фамилий встречаются чаще, чем в великорусской, что указывает на возможное происхождение рода с территории современной Украины или южных областей России.

Звуковой облик фамилии искажён диалектом. Литературное слово «дудка» в южнорусских и украинских говорах могло звучать как «дюдка» (через смягчение «д» перед «у») или «дюдюра». Отсюда и «дюдюрить» — играть на дудке, издавать однообразный звук. Фамилия Дюдюрка — не единственная в этом ряду: существуют однокоренные Дюдюра, Дюдюкин, Дюдюнов. Все они восходят к одному корню, но Дюдюрка — самая прямая и немоделированная форма, что делает её ценной для лингвиста: она сохранила прозвище почти без изменений.

Географически фамилия привязана к регионам, где распространено «дюканье» и «дюдюканье» — Черниговская, Полтавская, Курская, Воронежская области. Встречается она нечасто, что говорит о локальном бытовании прозвища. Носители фамилии Дюдюрка в прошлом, скорее всего, были крестьянами или казаками, а прозвище закрепилось за одним родом, не распространившись широко. Это не фамилия дворянского сословия или духовенства — её происхождение чисто народное, бытовое.