Фамилия Джагмазия — редкая, её корни уходят в Западную Грузию (регион Мегрелия). В мегрельском языке слово «джагма» означает «золото». Суффикс «-ия» — типичный для грузинских фамилий (сравните: Шенгелия, Чантурия, Берия). Таким образом, Джагмазия — это фамилия, образованная от прозвища «Золотой» или «Золотых дел мастер».

Скорее всего, основатель рода Джагмазия был ювелиром или менялой, либо же прозвище носило метафорический характер — так могли назвать дорогого, ценного человека (например, любимого сына или уважаемого старейшину). В грузинской ономастике фамилии на «-ия» часто указывают на принадлежность к определённому роду или местности, но в данном случае основа — конкретное ремесло или качество.

В отличие от русских фамилий на «-ов» и «-ин», грузинские фамилии на «-ия» не склоняются по падежам в русском языке (правильно: «познакомился с Джагмазией», «книга Джагмазия»). Фамилия не имеет отношения к арабскому или тюркскому миру, хотя слово «джагма» может напомнить арабское «джамаль» (красота) — это случайное созвучие. Основная версия — мегрельская, и она подтверждается географией: большинство носителей Джагмазия до сих пор живут в Грузии, особенно в Зугдидском районе.

В дореволюционной России эта фамилия была практически неизвестна за пределами Кавказа. В советское время, с миграцией грузин в разные республики, отдельные ветви Джагмазия появились в Москве, Тбилиси и Краснодарском крае. Фамилия не имеет дворянского статуса — это родовое имя ремесленников или крестьян, которое со временем закрепилось за потомками.