Фамилия Джалтырь — редкий случай, когда географический корень почти наверняка перевешивает любые другие версии происхождения. Основа фамилии — топоним Джалтырь, а точнее, название реки Джалтырь в Красноярском крае, правого притока Чулыма. В верховьях этой реки стоит село Джалтырь. Человек, носивший фамилию, с высокой долей вероятности был выходцем именно оттуда. Такие фамилии, образованные от названий малых рек и сел без дополнительных суффиксов, характерны для сибирских регионов, где переселенцам было достаточно указать на место прежнего жительства.

Морфология фамилии проста: корень «джалтыр» и нулевое окончание. Модель образования — бессуффиксная, что в русской ономастике встречается нечасто. Обычно фамилии оформляли суффиксами принадлежности (-ов, -ин) или притяжательности (-ский), но здесь мы видим «чистый» топоним, который стал прозвищем, а затем и фамилией. Это сближает Джалтырь с такими сибирскими фамилиями, как Томск, Иркутск или Байкал, но в отличие от них Джалтырь не стала городской, а осталась локальной.

Семантика самого слова «джалтырь» спорна и не имеет однозначной тюркской этимологии, хотя река протекает в зоне, где исторически жили тюркские народы (чулымские тюрки, хакасы). Возможно, в основе лежит древнее гидронимическое слово, значение которого утрачено. Пытаться выводить фамилию от личного имени или прозвища — значит игнорировать очевидную географическую привязку: на картах XVII–XVIII веков река уже обозначена, а значит, прозвище «Джалтырь» могло возникнуть только у пришлого русского населения, которое называло так человека «с Джалтыря».

Социальный контекст тоже ясен: это фамилия крестьян-старожилов, скорее всего, из числа сибирских казаков или пашенных крестьян, которые осваивали причулымье. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. Носители Джалтырь — это люди, чьи предки жили в глухой тайге, на берегу реки с непонятным названием, и фамилия намертво привязала их к этому месту. В современной России фамилия встречается крайне редко, в основном в Сибири, что только подтверждает её узкую географическую основу.