Фамилия Джанджария — яркий пример того, как русская письменность зафиксировала абхазо-адыгское звучание. Это не славянская и не тюркская фамилия: её корни ведут на Западный Кавказ, в Абхазию, где фамилии на -иа, -ба, -ва — обычное дело. Джанджария — это русифицированная форма абхазской фамилии Џьанџьариа (или Дзан-Дзариа). В основе лежит родовое имя, которое, скорее всего, восходит к прозвищу или тотему.

Суффикс -иа (в русской передаче -ия) в абхазском языке указывает на принадлежность к роду или местности. То есть Джанджария буквально означает «из рода Джанджар» или «Джанджаровы». Сама основа «Джанджар» (или «Дзан-Дзар») — сложная. По одной из версий, она восходит к абхазскому «аџьанџьар» — «сороконожка» или «многоножка». Вряд ли это прямое прозвище человека — скорее, тотемное имя древнего рода, где насекомое или животное почиталось как покровитель. По другой, более прозаичной версии, основа связана с личным именем или прозвищем, которое со временем стёрлось.

В отличие от русских фамилий, которые формировались через суффиксы -ов/-ев, абхазские фамилии не склонялись по падежам, а в русском языке получили окончание -ия, что сделало их похожими на грузинские (например, Гурия, Чикобава), но это чисто внешнее сходство. Внутри Абхазии носители этой фамилии традиционно живут в сёлах Гудаутского района, особенно в селе Лыхны — историческом центре абхазской знати. Там Джанджария — уважаемая фамилия, известная с XIX века.

В русском языке фамилия закрепилась без изменений, как и многие абхазские: её не переделывали на русский лад, не добавляли суффиксов. Поэтому Джанджария — это не «сын Джанджара» (как было бы по-русски), а «сам из рода Джанджар». Носители фамилии в России, как правило, потомки абхазских переселенцев времён Кавказской войны или более поздних миграций. Фамилия редкая, и её обладатели часто знают свою родословную до нескольких поколений — в абхазской культуре это ценится.