Фамилия Джайкеев — редкая и звучит не по-русски. Её основа, судя по всему, не славянская, а тюркская. Чтобы понять её происхождение, нужно отбросить русский патронимический суффикс -ев (указывающий на принадлежность: «чей?» — Джайкеев, то есть сын Джайкея) и посмотреть на корень «Джайкей».

Самая вероятная версия связывает фамилию с тюркским именем Джайкей (или Джаик). В тюркских языках «Джайык» (Jayıq) — это название реки Урал. У башкир, казахов и ногайцев Урал издавна назывался Яиком (после восстания Пугачёва переименован в Урал). Имя Джайкей могло быть образовано от этого гидронима: так могли назвать ребёнка, родившегося на берегу Яика, или же это было прозвище человека, жившего у этой реки. Встречаются и личные имена Джайк, Джаик, что подтверждает такую модель.

Менее распространённая, но возможная версия — от арабского имени Джаки (или Джакия) с тюркским суффиксом принадлежности -ей/-ай. В таком случае Джайкей — это «принадлежащий Джаки». Однако фамилия Джайкеев географически тяготеет к Оренбуржью, Башкортостану и северному Казахстану — регионам, где река Яик (Урал) была ключевым ориентиром. Поэтому гидронимическая версия выглядит убедительнее.

Фамилия Джайкеев почти не встречается за пределами этих мест. Она не попала в центральные губернии России и осталась локальной, что типично для фамилий, образованных от местных географических названий. Суффикс -ев, а не -ов, указывает на то, что основа имени Джайкей заканчивалась на мягкий согласный или «й».

Предки носителей фамилии Джайкеев, скорее всего, были тюркоязычными (башкирами, татарами или казахами), жившими вблизи реки Урал. Фамилия закрепилась в русской форме после присоединения этих территорий к Российской империи, когда для учёта населения требовалась стандартизированная фамилия по отцу.