Фамилия Джвартава — редкий пример грузинской фамилии, которая не вписывается в стандартные представления о «княжеских» или «крестьянских» окончаниях. Её основа и суффикс сразу выдают мегрельское происхождение: типичный для Западной Грузии суффикс -ава (в грузинском -ავა) указывает на принадлежность к роду или местности. В мегрельском языке этот формант выполняет ту же роль, что русское -ов или -ин: «чей?» — «Джвартава» буквально значит «принадлежащий Джварту».

Корень фамилии — «джварт» (ჯვართ) — восходит к грузинскому слову «джвари» (ჯვარი), то есть «крест». Это не ремесленное прозвище (не крестоносец и не крестильщик), а скорее топонимическое или храмовое имя. В Грузии множество мест, названных в честь креста: Джварис-хеви, Джварис-кари. Носитель фамилии Джвартава, вероятно, происходил из села или усадьбы, где стоял почитаемый крест, или же был связан с церковью, посвящённой Кресту Господню.

В отличие от более распространённых грузинских фамилий на -швили (сын) или -дзе (рождённый), мегрельские фамилии на -ава часто сохраняют более архаичную форму и указывают не на родство, а на место или качество. Джвартава могла возникнуть как прозвище человека, жившего у креста, или как фамилия семьи, владевшей землёй возле монастыря Джвари. Встречается она преимущественно в Мегрелии и Абхазии, где мегрельский язык был распространён исторически.

Современное написание фамилии — Джвартава — устоялось в русской транскрипции, хотя в грузинском оригинале ударение падает на первый слог: Джва́ртава. В документах XIX века могли встречаться варианты вроде Джвартов или Джвартадзе, но мегрельская форма оказалась устойчивее. Фамилия не имеет отношения к тюркским или абхазским корням — это чистый пример западно-грузинской ономастики, где географический или сакральный объект стал родовым именем.