Фамилия Ебёныш — редкий случай, когда основа настолько прозрачна, что сразу вызывает вопросы. В русском языке слово «ебёныш» — грубое просторечное обозначение глупого, упрямого или вызывающего раздражение человека, образованное от обсценного глагола. Однако ономастика редко работает по принципу прямого словарного значения: прозвища такого типа давали не «за ругательство», а за конкретную черту характера или поведения — например, за вздорность, нелогичность поступков или склонность к дурацким выходкам.

Словообразовательная модель фамилии — суффикс -ыш, типичный для русских прозвищ и фамилий, обозначающих лицо по характерному признаку (ср. Малыш, Глупыш, Крепыш). Формант -ев (в мужском роде Ебёнышев) указывает на принадлежность: «сын Ебёныша». В данном случае фамилия зафиксирована в усечённом варианте Ебёныш, что нетипично для русской патронимической традиции, где преобладают формы на -ов/-ев. Это может говорить о её позднем закреплении или о том, что прозвище настолько прочно приросло к человеку, что стало фамилией без дополнительного суффикса — явление редкое, но встречающееся в северных и сибирских говорах (ср. фамилии Дурень, Упырь).

Географически фамилия Ебёныш — крайне локальная. Основной ареал — юг России, в частности Краснодарский край, а также отдельные записи в Ростовской области. Это наводит на мысль, что прозвище могло возникнуть в казачьей среде, где прозвища давали меткие и нередко грубые. В официальных документах XIX века такая фамилия почти не встречается — вероятно, её носители были из крестьян или однодворцев, и фамилия оформилась лишь к началу XX века, когда крестьянам массово присваивали фамилии по уличным прозвищам.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Ебунин, Ебанов, Ебенко) показывает, что все они образованы от той же основы, но разными суффиксами. Ебёныш — самая экспрессивная форма: суффикс -ыш придаёт оттенок пренебрежительной уменьшительности, что усиливает эмоциональную окраску прозвища. В отличие от фамилий на -ов, которые со временем стёрли первоначальную резкость, Ебёныш сохранил её почти неизменной. По этой причине носители фамилии в XX веке нередко меняли её на благозвучные варианты, поэтому сегодня она считается исчезающей.