Фамилия Ебырь — редкий случай, когда основа настолько прозрачна, что не оставляет места для сложных этимологических споров, но при этом ставит вопрос о том, как и почему такое прозвище закрепилось в качестве родового имени.

Словообразовательная модель здесь проста: корень «еб-» (от глагола, обозначающего половой акт) плюс суффикс «-ырь». В русской антропонимии суффикс «-ырь» встречается нечасто, но он продуктивен в нарицательной лексике для образования имён деятелей или предметов с грубоватым, просторечным оттенком: «пустырь», «богатырь», «ковырять», а в диалектах — «зубырь» (задира) или «мутырь» (мутный человек). Таким образом, Ебырь — это не отчество и не географическое название, а прозвище по действию, причём с ярко выраженной негативной или шутливо-бранной окраской.

Вероятнее всего, прозвище Ебырь получил мужчина с необузданным нравом, бабник или человек, склонный к сквернословию. В крестьянской среде такие прозвища давали не столько для точной характеристики, сколько для насмешки или «отпугивания злых сил» — считалось, что грубое имя отпугивает болезни и неудачи. В отличие от фамилий на «-ин» или «-ов», которые образовывались от имени отца, прозвищные фамилии часто закреплялись за потомками сразу, минуя стадию отчества.

География фамилии крайне узкая. Фамилия Ебырь не встречается в исторических переписях дворянства, купечества или духовенства. Она фиксируется в основном в южнорусских и украинских говорах, где слово «ебырь» могло бытовать как диалектный вариант «ебуна» или «ебеца». В современных телефонных справочниках и базах данных носители единичны — несколько человек в Ростовской области и на Кубани, что подтверждает её локальный и недавний характер (возникла не раньше XVII–XVIII веков, когда прозвища начали массово превращаться в наследственные фамилии).

Сравнение с однокоренными фамилиями — Ебов, Ебин, Ебенко — показывает, что у всех них одинаковая основа, но разная модель оформления. Фамилии на «-ов» и «-ин» образованы от отчеств (чей сын? — Ебов сын), а Ебырь — это прямое прозвище, которое не склонялось по падежам в исходной форме. Именно это отличает её от более частых вариантов: она не говорит «чей», а говорит «кто».

В официальных документах фамилия могла записываться с «ять» или через «ѣ» (Ебырь), но в современной орфографии пишется через «е». В силу табуированности основы носители иногда меняли написание на Ебирь или Ебыр, но корень остаётся узнаваемым.