Фамилия Екапп — редчайший случай в русском ономастиконе. Она не вписывается в привычные модели образования русских фамилий: нет суффиксов -ов, -ин, -ский, нет окончания, типичного для прилагательного. Перед нами, скорее всего, фамилия-транслитерация, перенесённая в русскую графику из другого языка.

Наиболее вероятное происхождение — немецкое или скандинавское. В немецком языке существует фамилия Eckapp или Ekapp, которая может быть вариантом написания фамилии Eckhoff (Экгоф) или быть связана с топонимом. Корень Eck- означает «угол» или «остриё», а -app могло быть сокращением от Appel (яблоко) или же просто фамильным окончанием, не имеющим самостоятельного значения в русском восприятии. В Швеции и Норвегии встречается фамилия Ekapp, где Ek- — это «дуб», а -app — искажённое «река» (å). В таком случае Екапп могла означать «дуб у реки» и указывать на место жительства первого носителя.

В России эта фамилия могла появиться в XVIII–XIX веках вместе с приглашёнными на службу немцами, шведами или прибалтийскими немцами. Поскольку фамилия не обрусела (не получила типичного русского суффикса), её носители, вероятно, долго сохраняли иноязычную среду или же фамилия была записана в документах именно так, без адаптации. Встретить её можно в единичных случаях в центральных губерниях или в Петербурге, куда стекались иностранные специалисты.

Таким образом, фамилия Екапп — не прозвище и не отчество, а импортированное родовое имя, скорее всего, немецкого или скандинавского корня. Она указывает на предка-иностранца, который либо жил у дуба у реки, либо в угловом дворе.