Фамилия Ехзер представляет собой вариант фамилии Ёхзер, которая образована от аналогичного прозвища. Это прозвище восходит к немецкому слову Ochse. На русский язык оно переводится как «вол». Суффикс — er указывает на принадлежность к какой-либо профессии. Исходя из этого, можно предположить, что родоначальник Ехзер занимался животноводством.