Фамилия Еклерис — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В русском языке нет очевидной основы, от которой она могла бы быть образована, что сразу указывает на иноязычные корни. Скорее всего, это фамилия греческого происхождения, попавшая в русскую среду через переселенцев или духовенство.

Разбираем её по составу. В греческих фамилиях часто встречается суффикс -ис, указывающий на принадлежность или происхождение (например, Пападакис, Христофоров — с адаптацией). Основа «Еклер» может восходить к греческому слову «εχθρός» (эхтрос) — «враг», но это маловероятно для фамилии. Гораздо правдоподобнее, что перед нами вариант фамилии, образованной от личного имени или прозвища. Например, от «Εκλέρης» — возможно, топонимического происхождения: от названия местности Эклера (Εκλέρα) на Крите или в других регионах Греции. В таком случае фамилия означала бы «родом из Эклеры» или «принадлежащий к этому месту».

Другая версия — связь с тюркскими языками. В османский период греки Балкан и Малой Азии нередко носили фамилии, адаптированные из турецких слов. Основа «екле» (ekle) в турецком значит «добавлять», «присоединять». Суффикс -рис мог быть греческим окончанием, переделавшим турецкое прозвище. Но эта гипотеза слабее: суффикс -ис типичен для греческих фамилий, а не для заимствований из турецкого.

В России фамилия Еклерис встречается крайне редко, в основном в южных регионах (Краснодарский край, Ростовская область) и в среде потомков греческих переселенцев XIX–XX веков. Сословно носители могли быть как крестьянами-переселенцами, так и священнослужителями — греческие фамилии на -ис нередко получали выпускники духовных семинарий, где учились выходцы из Греции. Точной статистики по фамилии нет, но можно уверенно сказать: её носители — потомки людей, принесших эту фамилию из Средиземноморья, а не образовавших её на русской почве.