Фамилия Еконхо — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение почти наверняка не связано с исконно славянскими корнями. В ней нет привычных суффиксов -ов, -ин или -ский, что сразу указывает на позднее или иноязычное происхождение. Скорее всего, перед нами фамилия, возникшая в результате адаптации имени или прозвища из языков народов Кавказа, тюркской или, возможно, африканской группы.

Если отталкиваться от звучания, наиболее правдоподобна версия о кавказском следе. В абхазо-адыгских языках встречаются основы, близкие к «Екон» или «Екуа», которые могут означать «сын» или «потомок» в составе патронимических конструкций. Суффикс -хо в некоторых диалектах мог выполнять функцию указания на принадлежность к роду или местности. Таким образом, Еконхо могло означать «принадлежащий роду Екона» или «выходец из селения Екон». Фамилии такого типа часто фиксировались у черкесов, абазинов или кабардинцев во время массовых переселений в Османскую империю и обратно, а также при интеграции горских народов в российское подданство в XIX веке.

Менее вероятна, но не исключена тюркская версия. В тюркских языках существует слово «екін» (пашня, посев) или «екен» (как оказалось, оказывается). В этом случае фамилия могла возникнуть как прозвище земледельца или человека, который часто употреблял слово «екен» в речи (по принципу русских фамилий от междометий). Однако такая модель нетипична для оседлых тюркских народов, где фамилии чаще образовывались от имен отцов или названий профессий.

Встречаются единичные носители фамилии Еконхо в России, что подтверждает её экзотичность. Географически она может быть привязана к Краснодарскому краю, Адыгее или Карачаево-Черкесии — регионам, где исторически смешивались кавказские и тюркские языки. Из-за редкости фамилии её этимология остаётся открытой для споров, но кавказское происхождение выглядит убедительнее: оно объясняет и нестандартную структуру, и возможное значение «родовой» или «местный».