Фамилия Екпеткорйур с большой вероятностью не является исконно русской по происхождению. Её структура и звучание резко выбиваются из привычных моделей русских фамилий, образованных от прозвищ, имён или профессий с помощью суффиксов -ов, -ев, -ин, -ский. Скорее всего, перед нами искусственное образование или фамилия, возникшая в результате сложного переосмысления иноязычного слова.

Наиболее правдоподобная версия — фамилия возникла в среде духовенства. В XIX веке в семинариях было распространено давать будущим священникам «говорящие» фамилии, часто образованные от латинских, греческих или церковнославянских слов. В основе «Екпеткорйур» может лежать греческое слово, связанное с понятиями «избранный» или «выходящий из среды». Разобрать её можно как соединение корней: «ек» (от греч. «эк» — из, вне), «пет» (камень, твердь, возможно, искажённое «петр»), «кор» (собрание, хор, круг) и «йур» (неясная часть, возможно, вариант «юр» — место). В таком случае фамилия могла означать «избранный из собрания» или «камень, вынутый из круга», что символически указывало на оторванность от мирской жизни.

Менее вероятно, но возможно, что это поздняя русификация сложной иностранной фамилии, например, финно-угорского или прибалтийского происхождения. В таком случае исходное слово могло быть сильно искажено при записи в документах. Однако отсутствие типичных для тех регионов суффиксов и окончаний делает эту версию слабой.

Суффикса в привычном понимании у фамилии нет — окончание -ур не является типичным русским фамильным аффиксом. Это ещё одно подтверждение её искусственного или заимствованного характера. География бытования такой фамилии, скорее всего, узкая: её носители могли быть потомками священников из одного конкретного уезда или даже одной семинарии.

Таким образом, для носителя фамилии Екпеткорйур наиболее вероятной является версия о семинарском происхождении, где фамилия была сконструирована из греческих корней с возвышенным значением. Это редкий пример «учёной» фамилии, которая не описывает ремесло или внешность предка, а даёт духовную характеристику.