Фамилия Екпин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. На слух она кажется иноязычной, но если присмотреться к её строению, всё встаёт на свои места. Модель типично русская: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — Екпин, то есть сын или человек Екпы). А вот основа — Екп- — ключ к разгадке. Скорее всего, это усечённая или диалектная форма крестильного имени. В русской ономастике известен случай, когда полное имя Евтихий (от греческого «счастливый, удачливый») в народной речи сокращалось до Евтя, Ехтя, а в некоторых говорах — до Екта или Екпа. Фамилия Екпин, таким образом, могла произойти от прозвищной формы Екпа, которую давали человеку по имени Евтихий.

Менее вероятна, но возможна и другая версия — связь с диалектным словом. В некоторых северных и уральских говорах «екнуть» означало «ахнуть, удивиться» или «вскрикнуть». Тогда Екпа — прозвище для человека, который часто ойкал, удивлялся или говорил с характерным возгласом. Однако эта гипотеза слабее, так как прозвища от междометий в русской традиции редки и обычно имеют более явную мотивировку (например, Айка, Ойка).

Географически фамилия Екпин встречается крайне редко, в основном в центральных и восточных регионах России. Её носители, скорее всего, происходят из крестьянской или мещанской среды: суффикс -ин типичен для фамилий, образованных от прозвищ и неканонических имён, которые были широко распространены в низших сословиях до XIX века. Интересно, что фамилия не имеет вариантов с окончанием на -ов, что дополнительно указывает на её происхождение от личного имени, а не от названия профессии или места.