Фамилия Экусс — редкая и неочевидная для русского уха. Чтобы понять её происхождение, нужно сразу отбросить стандартные славянские модели на -ов, -ин или -ский. В фамилии нет привычных суффиксов, указывающих на принадлежность («чей сын?»), поэтому перед нами, скорее всего, застывшая основа — либо прозвище, либо транслитерация иноязычного слова.

Самый вероятный путь — французский или немецкий след. Фамилия Экусс (Écousse) может восходить к французскому écousse — «стручок», «шелуха», или к глаголу écousser — «вылущивать», «очищать от стручков». Такое прозвище могли дать крестьянину, занимавшемуся обмолотом бобовых, или, в переносном смысле, человеку суетливому, «шелушащемуся». В немецком языке возможна связь с Eckhaus — «дом на углу», но это менее вероятно, так как фамилия не сохранила типичного немецкого окончания.

В Российской империи фамилия могла появиться через обрусевших французов — пленных 1812 года, гувернёров или ремесленников. При переписи французское Écousse записывали на слух как «Экусс», без мягкого знака и двойных согласных. Встречаемость фамилии в современных базах крайне низкая, что подтверждает её нерусское происхождение: она не разошлась по деревням, а осталась в рамках одного-двух родов.

Словообразовательно фамилия проста: корень экус- (или экусс-) и нулевое окончание. Это типичная модель для фамилий, образованных от прозвищ без дополнительных суффиксов (ср. Коваль, Грек, Швед). Если же предположить, что основа — французское écu («щит»), то прибавляется суффикс -сс, который мог передавать уменьшительность или ироничность, но это уже спекулятивная версия.

Географически фамилия Экусс тяготеет к западным регионам бывшей Российской империи (Польша, Прибалтика, Петербургская губерния), где оседали выходцы из Европы. В современной России носителей можно пересчитать по пальцам, что делает фамилию уникальной — её обладатель почти наверняка является потомком конкретного переселенца, а не представителем массовой крестьянской фамилии.