Фамилия Эмбало — редкая и по звучанию совсем не славянская. Её корни, скорее всего, ведут на юг Европы, в итальянскую или испанскую языковую среду. В русском языке она выглядит как застывшая форма, лишённая привычных суффиксов -ов или -ин, что сразу подсказывает: перед нами не исконно русская фамилия, а заимствованная, адаптированная на слух.

Наиболее прозрачная версия — происхождение от итальянского топонима или прозвища. В Италии существует коммуна Эмбало (Embàlo) в провинции Палермо на Сицилии. Житель этого места или выходец оттуда мог получить прозвище Эмбало, которое затем закрепилось как фамилия. По той же модели образованы итальянские фамилии от названий городов: Романо (из Рима), Миланезе (из Милана). В пользу этой версии говорит и то, что многие сицилийские фамилии оканчиваются на -о и не имеют суффиксов.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с испанским глаголом embalar (упаковывать, тюковать). В этом случае фамилия могла возникнуть как профессиональное прозвище упаковщика или грузчика. Однако для испанской ономастики более типичны суффиксы -ero (embalador — упаковщик), поэтому прямая связь с глаголом без суффикса — редкий случай.

В русских документах фамилия могла появиться через переселенцев или потомков обрусевших итальянцев, работавших в России в XIX — начале XX века (архитекторы, инженеры, торговцы). При записи фамилии в паспорт или метрическую книгу её зафиксировали в той форме, в какой услышали — без изменений, так как она не поддавалась привычной славянской модели склонения.

Искать однокоренные фамилии среди русских бесполезно — Эмбало стоит особняком. Это фамилия-маркер, указывающая на южноевропейские корни её первых носителей, скорее всего, сицилийские.