Фамилия Емушинцева — женская форма, а её мужской вариант Емушинцев. Это редкая фамилия, и её разговорная, почти «деревенская» модель образования сразу бросается в глаза. В основе лежит суффикс -инцев-, который в русских фамилиях встречается нечасто. Он указывает на принадлежность к определённому роду или месту: если есть фамилии на -ов и -ин (Иванов, Пушкин), то -инцев — это как бы «сын того, кто был…» или «выходец из семьи…». В данном случае — «сын Емушинца».

Корень фамилии — Емуш- или Емуша. Скорее всего, это производное от неканонического имени или прозвища Емуша. В старорусском языке слово «емуша» могло быть диалектным вариантом слова «ямуша» — так в некоторых говорах называли ямщика, возчика на почтовых лошадях. Ямщики были людьми известными, их прозвища часто переходили в фамилии. Но есть и другая версия: Емуша — это уменьшительная форма от крестильного имени Емельян (через форму Емуля). В народе имена часто усекали: Емельян — Емуля — Емуша. Тогда Емушинцев — это «внук Емуши», то есть потомок Емельяна.

Примечательно, что фамилия Емушинцев практически не встречается в центральных и южных областях России. Основной ареал её бытования — северные и северо-восточные регионы, особенно Вологодская и Архангельская области, а также Пермский край. Это подкрепляет версию о ямщицком происхождении: на Севере и Урале ямская гоньба была развита сильнее, и прозвища по роду занятий закреплялись крепче.

Сама фамилия — типично русская, крестьянская или посадская, не дворянская. Суффикс -цев в фамилиях простого люда (в отличие от дворянских -ов) указывает на то, что предки не были владельцами вотчин, а жили своим трудом. Поэтому Емушинцевы — это, скорее всего, потомки либо ямщиков, либо крестьян, носивших имя Емуша.