Фамилия Эндыров — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В отличие от множества фамилий, образованных от крестильных имён (Иванов, Петров), основа здесь требует разбора. Скорее всего, в её основе лежит тюркское или монгольское слово, что указывает на восточные корни носителей.

Наиболее вероятная версия связывает фамилию с тюркским именем или прозвищем Эндыр (варианты — Андыр, Индыр). В ряде тюркских языков «эндыр» может означать «редкий», «единственный», «особенный». Такое имя могли дать долгожданному или единственному ребёнку в семье, подчёркивая его уникальность. Фамилия образована по русской модели с патронимическим суффиксом -ов, то есть «сын Эндыра». Это типичный случай, когда тюркское личное имя «обрусело» при переходе в фамилию в XVI–XIX веках.

Вторая, менее распространённая гипотеза, отталкивается от географического названия. В Башкортостане и Татарстане встречаются топонимы, созвучные с фамилией, например, деревня Эндыр (или Андыр). В этом случае фамилия могла указывать на выходца из такого места — «Эндыров» как «прибывший из Эндыра». Однако для фамилий на -ов, образованных от названий сёл, чаще используют суффикс -ский, поэтому версия с личным прозвищем выглядит убедительнее.

Словообразовательная модель проста: корень Эндыр- плюс суффикс -ов. Суффикс указывает на принадлежность, что типично для русских фамилий, возникших в среде служилых людей и крестьянства. Сословная принадлежность первых Эндыровых неясна — это могли быть как государственные крестьяне, так и служилые татары или башкиры, принявшие фамилию при переписях.

Стоит упомянуть, что фамилия Эндыров не имеет ничего общего с русским словом «ендова» (старинная посуда для вина) — это случайное фонетическое совпадение. Фамилия однозначно тяготеет к Волго-Уральскому региону, где смешение тюркских и славянских именных традиций было обычным делом. Встречается она в основном в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области, реже — в других регионах России.