Фамилия Енисейский — одна из тех, что прямо указывает на географическое происхождение человека или его семьи. Её основа — название великой сибирской реки Енисей. Предок носителей этой фамилии мог родиться или долго жить на берегу этого водоёма. Река дала не только прозвище, но и имя целому краю: Енисейским могли называть выходца из Енисейской губернии, существовавшей в 1822–1925 годах.

Само название реки имеет древние корни. По одной версии, оно восходит к древнекиргизскому «Эне-Сай» — мать-река. По другой — к эвенкийскому «Ионэсси», что означает «большая вода». Оба варианта точно передают масштаб: Енисей — граница между Западной и Восточной Сибирью, природный рубеж, где левобережные равнины сменяются горной тайгой правобережья. Река проходит через все климатические зоны — от Саян до Северного Ледовитого океана, так что в её верховьях водятся верблюды, а в низовьях — белые медведи и северные олени.

Фамилия образована по типичной модели с суффиксом -ский, который в русской ономастике чаще всего указывает либо на принадлежность к местности, либо на дворянское или духовное происхождение. В данном случае суффикс закрепил связь с топонимом: Енисейский — тот, кто с Енисея или из Енисейска. Город Енисейск получил статус города в 1676 году, и в его подчинение тогда передали все поселения по реке и правобережные территории до Забайкалья. Так что у фамилии есть и конкретный административный центр.

В отличие от фамилий на -ов или -ин, которые образуются от личных имён и прозвищ, Енисейский — типичный пример «географической» фамилии. Такие фамилии часто давали переселенцам, купцам, казакам или священникам, служившим в Сибири. Встретить её можно в основном среди потомков сибиряков, но из-за миграций носители разбросаны по всей стране.