Фамилия Енитская — редкий пример, где географическое имя перешло в фамилию почти без изменений. Это типичная топонимическая фамилия: её носители, скорее всего, происходят из населённого пункта с названием Енино, Ениха или Енитское. Суффикс -ск- указывает на принадлежность к месту: «из Ениного» или «с Енитского». Такие фамилии часто получали дворяне по названию своих поместий, но в XIX веке их массово присваивали и бывшим крепостным при освобождении — например, целым семьям из одной деревни давали фамилию по её имени.

Основа «Енит-» образована от личного имени или прозвища Еня. Это уменьшительная форма от нескольких крестильных имён: Евгений, Епифан, Елисей, Еремей. В быту Еней звали и просто человека с мягким, «енистым» характером — слово «ениться» в некоторых говорах означало «жаться, стесняться». То есть Еня могло быть и нецерковным прозвищем.

Интересно, что фамилия закрепилась именно в женской форме «Енитская», а не в мужской «Енитский». В официальных документах, вплоть до советских паспортов, женщинам часто записывали фамилию в женском роде, но если фамилия редкая и не имела широкого хождения, форма на -ая могла «приклеиться» к роду в целом. В русской ономастике это редкий случай: обычно топонимические фамилии на -ский склоняются по мужскому и женскому роду, но здесь, возможно, сказалась местная традиция или ошибка писаря.

По географии фамилия встречается в основном в центральных и северных областях России, где часты названия с корнем «ен-» (речка Ена, село Енино). Сословная принадлежность предков могла быть разной — от мелкопоместных дворян до государственных крестьян, но однозначных данных нет.