Фамилия Енсеуов — редкий пример, где необычное звучание сочетается с прозрачной, но неочевидной на первый взгляд этимологией. Внешне она напоминает русские фамилии на -ов, но её основа явно тюркская. Если отбросить патронимический суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?»), остаётся корень Енсеу. Скорее всего, это искажённое или адаптированное при записи тюркское имя или прозвище.

Наиболее вероятная версия связывает фамилию с казахским словом «енсеу» (енсею) — «становиться широкоплечим», «крепыш». В тюркских языках прилагательные и глаголы, описывающие внешность, часто становились личными именами-пожеланиями: родители называли так сына, желая ему силы и статности. Соответственно, Енсеу — это прозвище или некалендарное имя, которое получил родоначальник за крепкое телосложение. В русских документах XIX — начала XX века такие имена фиксировали на слух, поэтому возможны варианты написания: Енсеуов, Енсеев, Енсеулин.

Менее убедительна, но возможна связь с казахским «енсе» — «доля», «пай». В этом случае Енсеу могло означать «получивший свою долю» или «дольщик», что тоже могло стать прозвищем. Однако фонетически форма «Енсеу» больше тяготеет к глагольной основе, описывающей признак человека, чем к существительному.

Географически фамилия Енсеуов почти наверняка привязана к Казахстану и прилегающим регионам России (Оренбуржье, Астраханская область), где исторически вели учёт кочевого населения. Суффикс -ов вместо казахского -ұлы/-қызы или -ов/ев в этой среде — стандартная русификация, проводившаяся при записи в метрические книги и ревизские сказки. Таким образом, носитель фамилии Енсеуов почти наверняка происходит из казахского рода, а его предок выделялся физической мощью или, реже, был связан с распределением имущества.