Фамилия Эпштейн восходит к топониму Eppstein — такое название носят несколько местечек в Германии (например, в Палатинате и Гессе). Скорее всего, основатель фамилии Эпштэйн был уроженцем одного из этих селений. Фамилия Эпштэйн также распространена у евреев. Само название Eppstein происходит от двух немецких слов: Ebur - «дикий боров» и Stein - «камень».