Фамилия Эрмий — редкий случай, когда перед нами, скорее всего, не исконно русское, а искусственное или книжное образование. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий на -ов/-ев, -ин или -ский, эта имеет простую, неадаптированную форму мужского имени в именительном падеже. Такая модель — прямое заимствование без добавления суффикса — в русской традиции почти не встречается у крестьян или купцов, зато типична для духовного сословия, где фамилии нередко придумывали нарочито, по-латински или по-гречески.

Основа фамилии восходит к греческому имени Эрмий (Ἑρμῆς — Гермес). В дореволюционной России это имя давали в честь святого Эрмия (мученика IV века), и в церковном календаре оно присутствовало. Семинаристы, получавшие фамилию при выпуске, могли «перевести» своё мирское имя или просто взять красивое греческое слово. Поэтому носитель фамилии Эрмий, скорее всего, происходит из семьи священно- или церковнослужителя, который либо сам носил это редкое имя, либо получил фамилию как «учёное» прозвище.

Вторая, менее вероятная, но возможная версия — фамилия могла возникнуть из прозвища, данного человеку, которого сравнивали с Гермесом (Эрмием) — вестником богов, покровителем торговли и путников. Однако такая аналогия для русского быта маловероятна: мифологические сравнения в крестьянской среде почти не встречались. К тому же, прозвище в чистой форме без суффикса (Эрмий, а не Эрмиев) — нетипично для русского ономастикона, где даже княжеские фамилии типа Шуйский или Вяземский имели суффиксы.

Географически фамилия Эрмий может быть связана с южнорусскими или украинскими губерниями, где греческие имена в семинарской среде были особенно распространены, а также с районами, где жили греческие переселенцы. Но из-за крайней редкости точных данных о массовом бытовании нет. В советское время такая фамилия могла стать объектом неудобных вопросов («Ты что, бог?»), поэтому часть носителей могла сменить её на более привычную — Эрмиев или Гермесов.

Таким образом, фамилия Эрмий — это почти наверняка «семинарская» реликвия, след книжной культуры, а не народного прозвища. Её носители — потомки людей, получивших фамилию не от ремесла или отца, а от святого имени, выбранного по церковному календарю.