Фамилия Ермухометова происходит от мужского имени Ермухомет. Это имя — диалектный вариант персидско-арабского имени Ярмухаммет, которое состоит из двух корней: «яр» (близкий, любимый, друг) и «мухаммет» (восхваляемый, прославляемый). Мухаммет — имя основателя ислама, пророка Мухаммеда, поэтому имя Ярмухаммет означает «близкий друг Мухаммета».

Имя Ермухомет бытовало в тюркской среде, где начальное «я» часто переходило в «е». Такую же замену мы видим в фамилиях Ермуханов, Ермухаметов и других однокоренных. Фамилия Ермухометова образована по стандартной русской модели: к основе имени Ермухомет добавили суффикс -ов, а окончание -а указывает на женскую линию, хотя первоначально фамилия принадлежала мужчине — Ермухометову.

В дореволюционной России фамилии на -ов/-ев чаще всего получали крестьяне и мещане, реже — купцы и духовенство. Скорее всего, предок носителя фамилии был крещёным татарином, башкиром или представителем другого тюркского народа, принявшего православие. В крестьянской среде фамилии закреплялись за потомками одного человека, поэтому Ермухометовы — это род, ведущий начало от конкретного Ермухомета, жившего, вероятно, в XVII–XVIII веках.

Фамилия редкая, географически привязана к Поволжью и Приуралью — регионам, где веками жили тюркские народы и где имя Ярмухаммет было распространено. Встречается и вариант Ермухаметова — с сохранением второго «а» в корне, что ближе к исходному арабскому произношению.

Таким образом, фамилия Ермухометова хранит память о предке, носившем имя в честь пророка, и о его тюркских корнях.