Фамилия Еукубилов — редкий случай, когда основа не поддаётся однозначной славянской этимологии. Первое, что бросается в глаза: корень «Еукубил» не встречается в списках древнерусских имён, прозвищ или названий профессий. Скорее всего, перед нами фамилия, образованная от иноязычного личного имени или прозвища, которое попало в русскую среду через межнациональные контакты.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?» — Еукубилов, то есть сын или потомок Еукубила). Но что такое «Еукубил»? Вероятнее всего, это русифицированная форма тюркского или кавказского имени. В тюркских языках распространены имена с элементом «куб» (от «куб» — кувшин, или «кёб» — много), а также с суффиксом -ил, характерным для арабских заимствований. Например, имя Юкубил (вариант Якуб) могло в диалектном произношении дать «Еукубил». Другая версия: основа восходит к арабскому «аукуб» (след, путь) с добавлением уменьшительного суффикса, но это менее вероятно, так как такие формы редко переходят в фамилии.

Географически фамилия Еукубилов тяготеет к южным регионам России — Северному Кавказу, Нижнему Поволжью или Закавказью, где исторически были сильны тюркское и горское влияние. В метрических книгах XIX века подобные фамилии часто фиксировались у казаков или крестьян, контактировавших с нерусским населением. При этом носители могли быть как русскими по происхождению, так и представителями других народов, принявшими православие и фамилию по отцу.

Сравнение с однокоренными вариантами (Еукубилов, Юкубилов, Екубилов) показывает, что написание не устоялось: в разных документах одну семью могли записать по-разному. Это типично для фамилий, возникших на стыке языков, когда чиновник на слух передавал непривычное имя русскими буквами. Таким образом, Еукубилов — скорее всего, потомок человека по имени Еукубил (возможно, тюркского или кавказского происхождения), который жил в южных губерниях и чьё имя со временем обрусело. Других версий, заслуживающих серьёзного рассмотрения, ономастика не предлагает.