Фамилия Фалюскин — редкий пример, где фамильный суффикс рассказывает едва ли не больше, чем корень. В русских фамилиях суффикс -скин встречается нечасто. Обычно он возникает в двух случаях: либо как вариант фамилий на -ский (вроде Троицкий → Троицкин), либо при присоединении суффикса -ин к основе, оканчивающейся на -ск- (например, Моська → Москин). Фалюскин относится ко второму типу: это фамилия, образованная по модели «прозвище на -ск- + -ин», то есть «чей?» — Фалюскин означает «сын (или потомок) Фалюски» (или человека по прозвищу Фалюска).

Основа Фалюск- — это, скорее всего, прозвище или уменьшительное имя. Корень Фал- может восходить к краткой форме канонического имени Фаллей (греч. Таллей — «цветущий»). В русских говорах такие имена давали по святцам, но в быту использовали в усечённом виде: Фаля, Фалюха, Фалюшка. Прибавив суффикс -ск-, получили Фалюска — человека, которого называли по отцу или по характерной черте. Суффикс -ск- в прозвищах мог указывать на принадлежность («Фалюсков сын») или на местный говор.

География фамилии подсказывает, что это не случайное образование. Фалюскины встречаются в основном в центральных и южных областях России (Тамбовская, Воронежская, Ростовская области). В этих краях была распространена модель образования фамилий от просторечных форм имён с двойным суффиксом: Ивашкин (от Ивашка), Федькин (от Федька), Фалюскин — того же ряда. Сословно носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или мещанами: в дворянской среде такие «двойные» суффиксы почти не встречались.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с польским или белорусским именем Фалюс (от Фалей), где суффикс -ск- — типичный для восточнославянских фамилий показатель прилагательного, а -ин — русское окончание. Но в таком случае фамилия звучала бы как Фалюский или Фалюсов. Сочетание -скин выдаёт именно русскую народную этимологию: прозвище переделали под привычную модель «чей?». Так что Фалюскин — это фамилия, в которой имя предка «обросло» двумя суффиксами, а потом закрепилась в документах.