Фамилия Фатиниа — редкий случай, когда написание почти полностью совпадает с произношением, но происхождение корня неочевидно. Скорее всего, это вариант фамилии Фатина, образованной от женского имени Фатина (уменьшительное от Фатьма, арабское имя, распространённое у мусульманских народов). В таком случае суффикс -иа — нехарактерный для русской ономастики; он мог появиться при записи фамилии в документах, если носитель был из среды, где иноязычные окончания не русифицировали (например, у греков, болгар или в среде кавказских народов). Вторая версия: основа Фатин- может восходить к диалектному слову «фата» — покрывало, платок, а суффикс -иа указывает на принадлежность к роду по женской линии (как в фамилиях типа Мария — Мариа). Но это гипотеза, требующая подтверждения в местных говорах.

Географически фамилия Фатиниа практически не встречается в центральной России; её можно найти у малочисленных групп на юге страны, в Краснодарском крае или в Крыму, где смешение культур давало нестандартные фамильные формы. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) такого варианта нет — это указывает на его недавнее происхождение или на то, что фамилия пришла из другого языка и была адаптирована на слух. Если предки были крестьянами или казаками, прозвище Фатя (от Фатьма) могло закрепиться за человеком, который выделялся среди односельчан именем, а при паспортизации в XIX веке к основе добавили окончание -иа по аналогии с фамилиями на -ия (например, Георгия — Георгиев, но здесь без суффикса -ев).

Единственное, что можно сказать с уверенностью: фамилия не имеет отношения к французскому корню «fat» (толстый) — это ложное сходство. Более правдоподобна связь с тюркским именем Фатих (победитель) или арабским Фатима (отнятая от груди), где конечная -а перешла в -иа при письменной фиксации. Изучение местных архивов по одному из регионов — единственный способ узнать точную историю этой фамилии.