Фамилия Филаменко — характерный пример украинской фамилии, образованной по антропонимической модели на -енко. Такие фамилии в XVI–XVII веках закрепились в реестрах запорожских казаков и мещан Левобережной Украины, а суффикс -енко означал «сын» или «потомок». Таким образом, Филаменко — это «сын Филамена» или «потомок человека по прозвищу Филамен».

Основа фамилии восходит к греческому имени Филамен (Φιλάμενος), которое в древнегреческой мифологии носил сын царя Ификла, участник похода аргонавтов. Имя это означает «любящий» или «любезный». В православных святцах оно не встречается, поэтому в русскую традицию попало скорее через греческое влияние на южные земли, возможно, через греческих купцов или священников в Причерноморье. В украинской среде имя Филамен могло быть редким, но вполне употребимым, а от него пошли патронимические фамилии.

Интересно, что фамилия Филаменко — не единственная в этом гнезде. Есть Филаменов (русский вариант с суффиксом -ов) и Филаменков (с двойной моделью, указывающей на великорусское влияние). Но именно форма на -енко — самая древняя и локальная, она четко привязывает носителя к украинскому антропонимическому ареалу. По данным переписей XIX века, Филаменко встречалась в Полтавской и Харьковской губерниях, что совпадает с зоной активного бытования фамилий на -енко.

Споров о происхождении основы почти нет: вариант от славянского «филя» (простофиля) маловероятен, так как ударение и суффикс указывают на книжное, а не диалектное имя. Так что предки современных Филаменко — скорее всего, казаки или крестьяне, носившие редкое греческое имя, которое в быту превратилось в фамилию.