Фамилия Филлигрилимонов — редчайший пример искусственного, книжного происхождения. Она не выросла из прозвища, ремесла или имени предка, а была создана по модели русских фамилий на -ов из иностранного словосочетания. Основа здесь — французское «filigrème» (филигрань, тонкая проволочная работа) или итальянское «filigrana» (зернь, скань). К этому корню добавили фамильный формант -имонов, который встречается в единичных случаях и явно вторичен — он мог появиться по аналогии с фамилиями вроде Аристов или Христофоров, где основа оканчивается на -имон или -иман.

Скорее всего, фамилию придумали в духовной или семинарской среде. В XVIII–XIX веках будущим священникам нередко давали «благозвучные» фамилии от латинских или греческих слов, часто с нарочито усложнённым суффиксом. Филлигрилимонов мог получить выпускник семинарии, которого нарекли по церковному понятию «филигрань» — как символ тонкой, искусной работы души. Или же это переосмысление более простой фамилии Филлигримов (от того же корня), к которой кто-то добавил часть -лимонов для благозвучия и длины.

Географически фамилия почти не привязана. В современных телефонных справочниках и базах данных она встречается единично — в основном в центральной России и на юге. В дореволюционных метриках её тоже почти нет, что подтверждает: это не наследственное родовое имя, а поздняя, возможно, даже единичная запись, сделанная при крещении или поступлении в училище.

Написание с двойным «л» и «и» в первом слоге (Филлигрилимонов, а не Филигрилимонов) — не ошибка, а указание на исходное французское «filigrème», где ударение падает на последний слог. В русском языке фамилию часто произносят с ударением на «и» — Филлигрили́монов, но логичнее ставить ударение на «о»: Филлигрилимо́нов, по модели фамилий на -ов.

В отличие от массовых фамилий-прозвищ, Филлигрилимонов — это имя, которое кто-то однажды выбрал или сочинил. Носителей этой фамилии можно считать потомками человека, получившего её не по наследству от ремесленника или крестьянина, а по воле писаря или наставника, решившего отличить его редким и красивым словом.