Фамилия Фисаченко звучит как типичный пример украинской модели образования, но на деле таит небольшой сюрприз. Суффикс -енко, конечно, указывает на украинское происхождение: в XVII—XIX веках так называли сына или потомка человека с определённым прозвищем. Однако основа Фисак- здесь не столь прозрачна, как кажется.

Скорее всего, в основе лежит прозвище Фисак. Его могли дать обладателю густых, кудрявых волос — в украинских говорах «фиса» или «хвиса» означало завиток, клок волос. В этом случае Фисаченко — «внук (или сын) того, кого прозвали Кудряшом». Возможен и другой вариант: от диалектного глагола «фисати» (свистеть, шипеть), что могло закрепиться за человеком со свистящим голосом или характерным присвистом в речи.

Менее вероятна, но не исключена связь с личным именем Фиса как народной формой канонического имени Феодосий (в просторечии — Федос, Фиса). Тогда фамилия означала бы «потомок Фисы». Однако в украинской ономастике прозвищный след встречается чаще, чем уменьшительно-ласкательный от редкого имени.

Географически фамилия Фисаченко тяготеет к восточным областям Украины — Сумской, Полтавской, Харьковской, а также встречается на юге России, куда переселялись украинские крестьяне в XIX веке. В отличие от фамилий на -енко от очевидных профессий (Коваленко, Шевченко), эта указывает на внешнюю или речевую особенность конкретного предка — то есть на прозвище, которое не было широко распространено, а закрепилось в одном роду.

Сословный состав носителей Фисаченко не выделялся: это были в основном казаки и крестьяне, позже — мещане. Фамилия не встречается в дворянских родословных книгах, что подтверждает её «низовое» происхождение из среды простого люда.