Фамилия Флиер — редкий случай, когда происхождение лежит на поверхности, но не в русском, а в немецком или идишском слове. В основе лежит немецкое Flieger — «лётчик». Однако в России и Восточной Европе эта фамилия закрепилась задолго до появления авиации. Всё дело в том, что в XIX — начале XX века «флиером» называли не пилота, а разносчика писем и лёгких грузов, эстафетного гонца или скорохода. Это слово попало в польский и украинский языки из немецкого, где Flieger имело и переносное значение «быстроногий, бегун».

Таким образом, предок носителя фамилии Флиер, скорее всего, был почтальоном, курьером или посыльным, который передвигался пешком или на лошади. В некоторых регионах так могли прозвать и просто очень быстрого, подвижного человека. Суффикс в фамилии отсутствует — это чистая основа, что указывает на её позднее, часто искусственное закрепление в документах. В Российской империи фамилию могли дать еврейским семьям, жившим в черте оседлости, при переписи, выбрав за основу профессию или характерную черту.

Поскольку суффикса -ов или -ин нет, фамилия не склоняется по падежам как типичная русская. Это типично для фамилий, образованных от нарицательных существительных иноязычного происхождения, которые не прошли этап русификации. В Польше фамилия Flier встречается чаще, чем в России, и там её связывают не только с почтой, но и с ремеслом: в некоторых диалектах «flier» — это «стрелок из лука» или «метатель дротиков». Для русского контекста версия с гонцом или скороходом остаётся основной и самой правдоподобной.