Фамилия Флиогло стоит особняком в русском ономастиконе: её основа явно не славянская, а греческая. В русском языке она закрепилась благодаря потомкам греков, переселившихся на юг Российской империи в XVIII–XIX веках. В основе лежит греческое слово φίλος (филос) — «друг, любитель» — и λόγος (логос) — «слово, речь». Сложносоставное имя Филогос (Φιλόγος) в переводе означает «любящий слово», «красноречивый». Под влиянием южнорусского произношения и письменной передачи через молдавское или румынское посредничество (где «ph» перешло в «f») конечное -ос в безударной позиции превратилось в -о, а в суффиксальной части произошла перестановка звуков: Филиглос → Флиогло.

Фамилия распространена в Молдавии, на юге Украины (Одесская область) и в причерноморских регионах России. Встречается также вариант Филиогло, который ближе к исходной греческой форме. Носители фамилии — потомки греческих колонистов, которые селились в Новороссии и Бессарабии, занимались торговлей, мореплаванием, ремеслами. В метрических книгах XIX века Флиогло нередко записывали как купцов или мещан греческого происхождения; среди них были и священники греческих приходов.

Словообразовательная модель фамилии — бессуффиксальная, с застывшим греческим окончанием -о. В русской традиции такие фамилии не склоняются: Флиогло (мужской и женский род). Редкая особенность: фамилия не получила типичного славянского суффикса -ов/-ев, поскольку вошла в обиход уже в готовой греческой форме. Это отличает её от, например, греческих фамилий на -пуло (Панагопуло), которые в России часто русифицировали в Панагопулов. Флиогло сохранила исходное звучание, что указывает на относительно позднее вхождение в русскую среду и компактное проживание носителей.

Версия о связи с тюркским словом (например, «флиог» — якобы «буря» или «ветер») не подтверждается ни историческими источниками, ни данными тюркских языков. Наиболее убедительное объяснение — греческое, с опорой на антропонимику греков Причерноморья.