Фамилия Флусова звучит необычно для русского уха, но её происхождение уходит корнями в просторечие и, возможно, в средневековые ремёсла. В основе фамилии лежит не имя и не профессия в привычном смысле, а прозвище Флус — искажённая народная форма слова «флюс». Такое написание с буквой «у» вместо «ю» характерно для диалектного произношения, где непривычное заимствованное слово упрощалось до более удобного звучания.

Самое очевидное объяснение связано с болезнью. Флюсом в народе называли острый гнойный периостит — воспаление надкостницы, которое сопровождается сильной опухолью щеки и дёсен. Прозвище Флус могли дать человеку, часто болевшему или перенёсшему эту хворобу с заметными последствиями. Однако сводить всё к медицине было бы несправедливо: в горном деле и металлургии флюсом называют вещество (известь, плавиковый шпат), которое добавляют в шихту, чтобы понизить температуру плавления руды и отделить металл от пустой породы. Это делает вторую версию куда интереснее.

Если принять ремесленную гипотезу, то прозвище Флус мог получить мастер, хорошо разбиравшийся в тонкостях плавки, либо рабочий, который готовил и подбирал флюсы. В уральских и сибирских горнозаводских сёлах, где в XVIII–XIX веках жили целые династии плавильщиков, такие прозвища могли закрепляться за семьями. Правдоподобие этой версии усиливает и то, что фамилия Флусова встречается крайне редко и не имеет массового распространения, что типично для фамилий, возникших в узкой профессиональной среде, а не среди широких крестьянских масс.

Впрочем, не стоит исключать и чисто бытовую иронию. В говорах словом «флус» могли дразнить капризного, «раздутого» от важности человека или того, кто любил прихворнуть. Такая насмешливая модель образования прозвищ — от внешних признаков или поведения — одна из древнейших в русской антропонимии.

Морфологически фамилия Флусова — классическая русская фамилия, образованная по патронимической модели: суффикс -ов присоединяется к основе прозвища и указывает на принадлежность потомку человека по имени Флус. Форма Флусова, а не Флусов, говорит о том, что фамилия закрепилась в женском роде или передалась через женскую линию, что нередко случалось при оформлении документов в XIX веке.

Стоит отметить, что в письменных источниках фамилия практически не встречается до начала XX века, что косвенно подтверждает её позднее и, вероятно, локальное происхождение. В современных справочниках по ономастике отдельного разбора этой фамилии нет, поэтому исследователям приходится опираться на аналогии с однокоренными фамилиями Флюсов, Флюсов, а также на диалектные словари, где зафиксированы формы «флус» и «флюс» в обоих значениях — и болезни, и металлургического термина.

Таким образом, перед нами редкий случай, когда одна фамилия может вести род сразу от двух разных миров — от деревенской знахарской избы, где лечили опухоли, и от дымного завода, где плавили руду. Какая из версий верна для конкретной семьи, можно установить только по архивным записям о месте жительства предков. Если родословная тянется с Урала или из горнозаводских районов, версия с металлургией выглядит предпочтительнее; если предки были крестьянами центральной России — вероятнее болезненное прозвище.