Скорее всего, Флюкратов – это русифицированный вариант немецкой фамилии Флюкрат. Предположительно, она ведет свое начало от имени Флюкрат, которое восходит к двум основам: vlücke – «веселый, жизнелюбивый» и rat – «разумный». Согласно другой версии, в основе этой фамилии лежит прозвище Флюкрат, которое восходит к двум нижненемецким словам Fluh – «отвесная скала» и Kratt – «мелкий дубовый кустарник». Подобное прозвище могло указывать на место жительства родоначальника: на скале, поросшей кустарником.