Фамилия Фомской — редкая и неочевидная. На первый взгляд, она похожа на притяжательное прилагательное, но суффикс -ск- здесь указывает на совсем другую модель образования, чем, скажем, в фамилии Фомин.

Скорее всего, перед нами фамилия, образованная от географического названия. В основе лежит топоним Фомск — название населённого пункта. Таких деревень или сёл в России было немного, и все они, вероятно, связаны с именем основателя или владельца — Фома. От названия «Фомск» и возникла фамилия, отвечающая на вопрос «откуда?»: Фомской — выходец из Фомска. Эта модель типична для дворянских и духовных фамилий, которые часто закреплялись за семьями по названию их вотчины или места служения.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная: фамилия могла возникнуть как прозвище, закреплённое за человеком, который жил у «фомы» — так в некоторых говорах называли загон для скота или огороженное место. Однако в этом случае ожидался бы суффикс -ской, а не -ской, что грамматически спорно.

Обратите внимание на окончание: Фомской, а не Фомский. В XIX веке фамилии на -ской нередко склонялись как прилагательные мужского рода (Фомского, Фомскому), что сохранилось в церковной и дворянской среде. Если ваши предки были из духовенства или мелкопоместных дворян, такая форма вполне закономерна.

Поскольку фамилия встречается редко, её носители, скорее всего, ведут происхождение из одного или двух родовых гнёзд. Поиск по архивам стоит начинать с европейской части России, особенно с регионов, где было распространено имя Фома и где существовали селения с корнем «Фом-».