Фамилия Фомущенко звучит так, будто за ней стоит целая история, и это действительно так. Она образована по типичной для восточной Украины модели: основа плюс суффикс -енко, который в XVI–XVII веках означал «маленький» или «сын». То есть Фомущенко — это буквально «сын Фомы». Исходное имя Фома — это русская форма апостольского имени Фома (от арамейского «близнец»). В украинской традиции оно звучало как Хома, но в фамилии закрепился полногласный русский вариант — Фома.

Интересно, что суффикс -енко в этой фамилии стоит не сразу после корня, а после суффикса -ущ-. Это редкая деталь: обычно украинские фамилии на -енко образуются от прозвищ или имён напрямую (Фоменко, Фомин). Здесь же мы видим форму Фомущ- — возможно, от уменьшительно-ласкательного Фомуша или от прозвища, которое давали человеку с каким-то характерным признаком, связанным с именем Фома. Такая модель (основа + -ущ- + -енко) встречается у фамилий вроде Иванущенко, Петрущенко, но реже, чем простые варианты.

Географически фамилия Фомущенко тяготеет к центральным и восточным областям Украины — Черкасской, Полтавской, Харьковской. В России она встречается, но редко, и чаще всего как след переселенцев с Украины в XVIII–XIX веках, когда малороссийские крестьяне и казаки осваивали южные губернии. Предки современных Фомущенко, скорее всего, были не знатного рода: фамилии на -енко в массе своей принадлежали казакам, мещанам и крестьянам, а не шляхте.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Фомущенко стоит в одном ряду с Фоменко, Фоминым и Фомченко. Разница в суффиксе указывает на разное время и место возникновения: Фомин — древнерусская форма (от краткого прилагательного), Фоменко — массовая украинская, а Фомущенко — более локальный, возможно, юго-восточный вариант, где цокающее произношение или диалект повлияли на форму. Спорных версий здесь немного: основа очевидна, и альтернативные толкования (например, от слова «фомка» — отмычка) маловероятны, так как в основе лежит именно имя.