Фамилия Фузайлова — редкая и с неочевидной этимологией. Она образована по стандартной русской модели с суффиксом -ов, который указывает на принадлежность («чей?»): Фузайлов — сын или потомок человека по имени или прозвищу Фузайло, а Фузайлова — женская форма. Основа фамилии — прозвище или неканоническое имя Фузайло.

Корень «фуз-» нехарактерен для славянских языков. Самая вероятная версия — тюркское происхождение. В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) есть слово «фуза» или близкие звучания, означающие «беспокойный», «суетливый», «легкомысленный» или «пустой, никчёмный человек». Суффикс -айло в русских фамилиях часто передаёт тюркские основы через уменьшительную или пренебрежительную форму: Фузай — «суетливый человек», Фузайло — «тот, кто суетится».

Менее правдоподобна, но возможна версия от арабского «фуад» (сердце) через искажение в устной речи, но для этого нет надёжных лингвистических оснований — переход «д» в «з» в русских говорах не зафиксирован.

Географически фамилия Фузайлова встречается в Поволжье и на Урале — в зоне активных русско-тюркских контактов. Это косвенно подтверждает тюркскую версию: предки носителя фамилии могли быть крещёными татарами, башкирами или чувашами, получившими прозвище за характер или поведение. В русской среде фамилия не имеет однокоренных аналогов, что говорит о её изолированном происхождении.

О сословной принадлежности Фузайловых судить сложно: фамилия не встречается в дворянских родословных книгах, что указывает на крестьянское или мещанское происхождение. Скорее всего, прозвище закрепилось за одним родом в конкретной деревне, а не возникло массово в разных местах.