Фамилия Габидаидзе — яркий пример грузинской модели образования фамилий, где суффикс -идзе указывает на происхождение от отца или предка по мужской линии. В дословном переводе с грузинского «Габидаидзе» означает «сын Габиды» или «потомок Габиды». Суффикс -идзе (в западной Грузии распространён вариант -швили) исторически закрепился за дворянскими и княжескими родами, но со временем стал массовым и встречается у самых разных сословий, особенно в Имеретии, Гурии и Аджарии. Таким образом, носитель фамилии Габидаидзе почти наверняка ведёт род из западной части Грузии.

Основа фамилии — личное имя или прозвище Габида. В грузинской антропонимике имя Габида может быть производным от арабского «габид» (عابد — «поклоняющийся», «раб Божий»), что отражает влияние исламской культуры в регионе, особенно в Аджарии, где долгое время был силён османский фактор. Вторая, менее распространённая версия, связывает Габиду с грузинским словом «габида» (габида — «вьюк», «ноша»), что могло быть прозвищем грузчика или торговца, переносившего товары. Однако первая версия — с религиозным подтекстом — выглядит убедительнее, так как имена с корнем «абд» (раб) типичны для мусульманского именослова, а в Грузии, особенно в южных регионах, такие имена встречались у грузин-мусульман.

В отличие от фамилий, образованных от распространённых имён вроде Георгидзе или Давидадзе, Габидаидзе — более редкая и локальная фамилия. Её носители, вероятно, сосредоточены в Аджарии или соседних районах, где смешивались грузинские и османские традиции. В русских источниках фамилия могла писаться с вариациями (Габидадзе, Габидаидзе), но грузинская орфография закрепляет именно форму с -идзе.

Что касается социального статуса предков, то, в отличие от фамилий на -швили, которые часто носили крестьяне, суффикс -идзе изначально был привилегированным. Однако к XIX веку разница стёрлась, и Габидаидзе могли быть как мелкими дворянами, так и свободными крестьянами. Точных данных о сословной принадлежности по этой фамилии нет, но можно предположить, что предки не принадлежали к высшей аристократии — иначе фамилия была бы более известна и упоминалась в исторических хрониках. Скорее всего, это была фамилия зажиточных ремесленников или торговцев из приморских или горных районов Грузии.