Фамилия Габшакурова звучит непривычно для русского уха, и это прямой намёк на её происхождение. Она явно не из списка типичных «профессиональных» или «географических» русских фамилий, а связана с языками народов Кавказа. Основа фамилии — «Габшаку» — почти наверняка восходит к аварскому или кумыкскому личному имени, распространённому у дагестанских народов.

Суффикс «-ов» (в женском роде «-ова») указывает на стандартную русскую модель образования фамилий, которая была заимствована и адаптирована в XVIII–XIX веках в среде горских народов, когда их начали фиксировать в российских документах. Таким образом, Габшакуров — это русифицированная форма отчества: «сын Габшаку». Само имя Габшаку, скорее всего, сложносоставное. Первая часть «Габш» может быть диалектным вариантом имени «Гапш» или восходить к тюркскому слову со значением «крепкий», «сильный». Вторая часть «-аку» — распространённый аварский и кумыкский суффикс, образующий уменьшительно-ласкательные или уважительные имена, вроде русского «-енька» или «-ка».

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с арабским корнем, означающим «печаль» или «скорбь», но в тюрко-кавказской ономастике это встречается редко. Первая версия — с именем-пожеланием силы и крепости — выглядит убедительнее.

Географически фамилия привязана к Дагестану, в первую очередь к аварским и кумыкским районам. Встречается она нечасто, что говорит о её локальном характере: возможно, предки носителя фамилии были жителями одного конкретного аула или тухума (родовой общины). В XIX веке, при включении горских обществ в состав Российской империи, многие горцы получали фамилии по имени отца или деда, что и закрепило за ними форму на «-ов». Социальный статус предков мог быть разным — от узденей (свободных общинников) до зажиточных крестьян, но с высокой вероятностью это были не князья и не рабы, а свободные горцы, для которых имя «Габшаку» было родовым прозвищем или личным именем.