Фамилия Габзяминов — редкая, её происхождение напрямую связано с тюркскими языками, скорее всего, с татарским или башкирским. В основе лежит личное имя Габзямин (или Габдзамин), которое представляет собой сложносоставную арабо-мусульманскую форму. Первая часть «Габд-» восходит к арабскому «абд» — «раб» (в значении «раб Божий»), вторая — «зямин» — вариант имени Замин, которое означает «земля», «почва», или же восходит к арабскому «амин» — «верный», «надёжный». Таким образом, полное имя можно интерпретировать как «раб Верного» (то есть раб Всевышнего) или «раб Земли» — в зависимости от того, какой корень считать основным. В любом случае, это теофорное имя, распространённое в среде мусульман Поволжья и Приуралья.

Русский суффикс -ов превратил тюркское имя в фамилию по стандартной модели: Габзямин + ов = Габзяминов. Окончание -ов указывает на принадлежность: «сын Габзямина» или «из рода Габзямина». Фамилия закрепилась, скорее всего, в конце XIX века, когда у татар и башкир начали массово оформлять фамилии по русскому образцу — для учёта в переписях и воинской повинности.

Ареал фамилии — преимущественно Татарстан, Башкортостан, Оренбургская область. Встречается также у мишарей и казанских татар, где имя Габзямин (в форме Габдзамин) фиксируется в метрических книгах. Носители фамилии, скорее всего, происходят из крестьянского или мещанского сословия: дворянство среди татарских фамилий с таким корнем нехарактерно, а духовенство (муллы) чаще носило фамилии на -уллин или -ов из арабских имён с «абд».

Важная деталь: написание с буквой «з» — Габзяминов — может быть результатом оглушения или диалектного произношения. В более точной арабографической записи имя выглядело бы как Габд-аз-Замин, где «з» — это звонкий согласный, но в русской передаче он мог упроститься. Это отличает фамилию от более частых Габдуллин, Габдрахманов и показывает локальный вариант имени, не попавший в массовые справочники.