Фамилия Гаджиисаева — яркий пример того, как русская фамильная модель наложилась на мусульманскую антропонимию. С точки зрения словообразования это типичная «матронимическая» или «отцовская» форма на -ов/-ев, характерная для многих народов Кавказа, Закавказья и Поволжья, принявших русскую паспортную систему. Основа здесь — двусоставное арабское имя Гаджииса, которое распадается на «Гаджи» (почётный титул для мусульманина, совершившего хадж в Мекку) и «Иса» (арабизированная форма имени Иисус, почитаемого в исламе как пророк). Буквально Гаджииса означает «паломник Иса» или «Иса, совершивший хадж».

Суффикс -ев (а не -ов) появился потому, что основа имени заканчивается на мягкий или шипящий звук (в данном случае на «а» в русском произношении, что даёт форму притяжательного прилагательного). Таким образом, Гаджиисаева — это «дочь (или жена) Гаджиисы». В русской традиции фамилии на -ев/-ов фиксировали принадлежность к роду, и в данном случае родоначальником был мужчина с именем Гаджииса.

Географически фамилия Гаджиисаева почти наверняка указывает на дагестанское происхождение. Сочетание имени «Гаджи» с именем пророка Исы особенно распространено у лезгин, аварцев, даргинцев и других народов Дагестана, где арабские имена вплелись в местную ономастику. Встречается она и у чеченцев, ингушей, а также у азербайджанцев, но с меньшей частотой. Фамилия не является ни древнерусской, ни дворянской — она возникла не раньше XIX века, когда на Кавказе начали массово фиксировать фамилии по русскому образцу.

Интересная особенность: в отличие от русских фамилий, где суффикс -ев/-ов чаще указывает на отца, в мусульманских семьях фамилию могли дать и по имени деда, и по имени уважаемого предка-паломника. Поэтому Гаджиисаев может быть не прямым потомком человека по имени Гаджииса, а членом рода, который чтил этого паломника как основателя фамильной ветви. Ударение в фамилии, скорее всего, падает на третий слог: Гаджиисáева (хотя в бытовой речи встречаются варианты).

Если искать параллели, то однокоренные фамилии — Гаджиев, Гаджимурадов, Исаев. Но двойное имя в основе встречается реже, что делает фамилию более локальной и узнаваемой в своей среде.