Фамилия Галафутник — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, она украинская или южнорусская, что выдают суффикс -ник и характерный корень. В основе лежит прозвище Галафут — так могли назвать человека с определённой походкой или поведением. Первая часть, «гала-», восходит к глаголу «галайдать» (кричать, шуметь) или «галайда» (гуляка, буян). Вторая часть, «-фут», почти наверняка искажённое немецкое «Fuss» (нога) через польское или еврейское посредничество. Итоговое прозвище могло означать «шумный, бродячий человек» или «тот, кто ходит с гамом». Суффикс -ник в украинской традиции часто указывал на род занятий или характерную черту: Галафутник — «сын Галафута» или «человек, похожий на Галафута».

Есть и вторая, менее вероятная версия: фамилия могла возникнуть как профессиональная. В говорах юго-запада России «галафутом» называли бродячего торговца, коробейника или даже мелкого вора, промышлявшего на ярмарках. Тогда Галафутник — это «тот, кто занимается галафутством». В пользу этой гипотезы говорит продуктивность модели «прозвище + -ник» для обозначения ремесленников (ср. бондарь — бондарник, гончар — гончарник).

Географически фамилия тяготеет к Черниговской, Полтавской и Харьковской губерниям Российской империи, а также к современным восточным областям Украины. В России она встречается точечно, чаще всего у потомков переселенцев с Украины. Встречаются варианты написания: Галафутников (с русским суффиксом -ов) и Галафутенко (типично украинский патроним). Эти варианты подтверждают, что исходная фамилия не была застывшей и прошла адаптацию в разных языковых средах.

Дворянства за этой фамилией не числится — это типичная крестьянская или казачья фамилия, образованная от уличного прозвища. Её редкость объясняется тем, что прозвище Галафут было локальным и не вошло в общерусский обиход.