Фамилия Гальотова — женская форма, а её мужской вариант Гальотов. Сразу бросается в глаза необычное сочетание звуков: мягкое «ль» и ударное окончание «-ов». Такое написание редко встречается в русских фамилиях, что наводит на мысль о нерусском происхождении основы.

Скорее всего, корень «Гальот» восходит к итальянскому или французскому слову «galiot» (галиот). В эпоху парусного флота галиотом называли небольшое двухмачтовое судно, распространённое в Средиземноморье и Северной Европе. В русском языке слово закрепилось в петровскую эпоху, когда в Россию приглашали иностранных корабелов и моряков. Прозвище Гальот могли дать либо самому мореходу, либо судостроителю, либо человеку, чем-то напоминавшему это судно — скажем, быстрому или невысокому ростом. Суффикс «-ов» в таком случае — типичный русский патронимический формант, который «обрусел» фамилию: сын Гальота стал Гальотовым.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным глаголом «галить» (насмехаться, глазеть) или с именем Галактион (в просторечии Гальон). Однако в таком случае фамилия обычно выглядит как Гальонов или Галитов, а форма Гальотов тяготеет именно к заимствованному «галиот». Подтверждение этому — единичные, но устойчивые упоминания фамилии в приморских регионах, например, среди казаков Черноморского побережья и в архивных записях Одесской губернии XIX века.

Социальный состав носителей был пёстрым: от матросов и рыбаков до мещан и купцов, торговавших с заграницей. Фамилия редкая, не попала в массовые списки дворянских родов, но сохранилась в южных областях России и на Украине. Сегодня её можно встретить в Краснодарском крае, Крыму и Ростовской области.